Nach den Ereignissen aus Beast Wars finden sich Optimus Primal, Cheetor, Black Arachnia und Rattrap ohne Gedächnis auf Cybertron wieder. Unfähig sich in Roboter zu transformieren werden sie von einer riesigen, unbekannten Armee aus Drohnen angegriffen und müssen sich in den Untergrund des Planeten zurückziehen. Dort finden sie das geheimnivolle Orakel, dass ihnen neue, technoorganische Körper gibt, mit denen sie die hirnlosen Angreifer besiegen kônnen … Nach einiger Zeit stellt sich dann heraus dass Megatron, der Erzschurke aus Beast Wars, für all das Chaos verantwortlich ist und einen völlig aberwitzigen Plan verfolgt, für den er alle Sparks (die Seelen der Transformers) benötigt. Vor allem will er aber Cybertron von seinen organischen Elementen befreien, welche die „maschinelle Reinheit“ Cybertrons verunreinigt. Optimus Primal und das Orakel aber wollen ein natürliches Gleichgewicht zwischen Technologie und Biologie herstellen, und so entbrennt zwischen Megatrons Drohnenarmee und Primals Rebellentrupp ein erbitterter Krieg um die Zukunft des Planeten.

In späteren Episoden erinnern sich die Helden dann nach und nach an ihre Ankunft auf Cybertron und finden auch ihre verlorenen Freunde wieder, die sich seit damals sehr verändert haben … 

Die neue Transformerserie ist die wohl düsterste von allen. Ebenfalls komplett in 3D liefern sich die guten Maximals jede Menge Schlachten mit den feindlichen Drohnen, doch es gibt auch viele ruhige, psychologische Szenen, in denen die Helden nicht mehr weiter wissen oder an ihren noblen Idealen zweifeln. Das alles, und vor allem die letzte Episode, macht Beast Machines zur wohl kontroversesten Serie unter den Fans. Die einen lieben sie wegen den intelligenten Geschichten und der Spannung, andere wiederum hassen sie weil sie mit dem Original von 1984 kaum noch etwas zu tun hat. Im Gegensatz zu ALLEN Transformerserien wurde diese aber KOMPLETT auf Deutsch übersetzt, und das Ergebnis ist stellenweise sogar noch besser als in der englischen Version. (Text: Wheeljack83)